Han föddes i Wilthaus, nuvarande Schweiz, i kantonen St Gallen. Han studerade teologi i Wien och Basel. Han vigdes till präst 1506 och från 1519 blev hans huvudsakliga sysselsättning Zürich.
Från 1516 var han i korrespondens med Erasmus av Rotterdam, en vän till Luther. Han var mycket bekant med Luthers skrifter.
Enligt Zwingl skulle hela människans liv vara en tjänst.
Han började kräva reformer i kyrkan, såsom evangelisk kommunion, borttagande av bilder från kyrkor och kyrkans ansvar för att ta hand om de fattiga. Alla bordeller i staden fick också stängas.
Zwingl-reformationen ställde alltså krav på religiös och social förnyelse.
Hans reformation var nationell till sin natur och ledde till det protestantiska och katolska kantonkriget i Schweiz, där Zwingli själv och 400 andra anhängare dog.
Den största skillnaden doktrinärt från Luther var föreställningen om nattvarden. Försök gjordes att förena läran om nattvarden i Marburg i en religiös debatt. Företaget misslyckades. För Zwingl var nattvarden ett tecken på bekännelse och plikt, en symbol. Nattvarden symboliserade bara Kristi kropp och blod.